A chlamydia tünetei közül a legáltalánosabb, hogy nincsenek konkrét tünetei, így az egyik legalattomosabb, elsősorban szexuális úton terjedő fertőzés egyike. Mindkét nem esetében jellemző betegség, de főleg a nőknél gyakori. A chlamydia tünetei általában nagyon enyhék, de a későbbi szövődmények súlyosabbak lehetnek, így például a meddőség, a méhen kívüli terhesség vagy a sterilitás egyik kiváltója is lehet. A nők felénél általában teljesen tünetmentesen jár együtt a fertőzés, a tünetek pedig olyan enyhék, hogy gyakran nem keresnek szakszerű segítséget.
A fertőzés általában 4-28 napos lappangási idővel bír, a chlamydia tünetei ekkor jelentkeznek először, méghozzá vizelés közbeni égető érzés vagy férfiak esetében a hímvessző váladékozása esetében, amely leginkább átlátszó, de mindenképpen hígabb, mint gonorrea esetén. A férfiak esetén előfordulhat még gyakori vizelési inger, amely fájdalommal is járhat, valamint a húgycsőből származó gennyes váladékkal. A nők esetében a chlamydia tünetei hasonlók, a gyakori vizelési inger mellett felléphet alhasi fájdalom, fájdalmas vizelés, közösülés alkalmával tapasztalható fájdalom, valamint sárgás, gennyes váladékozás.
